Le système de fusion d'Olympus Merge s'appuie sur un principe simple mais profond : deux tuiles identiques fusionnent en une tuile de rang supérieur lorsqu'elles se touchent. Chaque partie débute avec une grille vide et un nombre limité de mouvements, généralement entre 12 et 25 selon le mode de jeu sélectionné.
L'application affiche en permanence la tuile suivante qui apparaîtra, permettant une planification stratégique. Les joueurs font glisser cette tuile vers une case libre de la grille, créant ainsi des chaînes de fusions. Le score final dépend du nombre de fusions réalisées et du niveau maximal de tuile atteint, le casque de Zeus représentant l'accomplissement ultime.
La progression suit une hiérarchie visuelle claire : éclair doré, aigle blanc, temple coloré, puis casque divin. Chaque fusion génère des points, multipliés par des bonus 100× ou 250× selon les combinaisons créées. Le moteur de jeu garantit une réactivité immédiate même sur les appareils Android modestes grâce à une optimisation poussée du rendu graphique.